思陌智能科研服务长期深耕医疗人工智能,在科研服务过程中系统梳理了国内外主流的公开医疗数据集。本页按模态与应用场景分类汇总,涵盖医学影像、病理图像、专科影像、电子病历、多模态及医学大模型评测基准六大类,方便医疗机构与科研团队快速定位所需数据资源。

医学影像(放射 · CT / MRI / X光)

面向放射与影像组学研究的公开数据集,覆盖胸部X光、肺结节CT、脑部MRI等主流模态,多数附带专家标注与结构化报告,是医学影像AI的经典训练与评测数据。

胸部X光

MIMIC-CXR

胸部X光影像与结构化报告
机构
MIT / 贝斯以色列女执事医疗中心
规模
37万+ 图像 · 22万+ 检查

胸部多病种分类、影像报告自动生成、图文检索

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胸部X光

CheXpert

胸部X光多标签分类
机构
斯坦福大学
规模
22.4万 图像 · 6.5万 患者

14类胸部观察项多标签分类、不确定性标签学习

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胸部X光

NIH ChestX-ray14

胸部X光14种疾病
机构
美国国立卫生研究院(NIH)
规模
11.2万 图像 · 3万+ 患者

14种胸部疾病分类、弱监督定位

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胸部X光

RSNA Pneumonia Detection

肺炎检测挑战
机构
北美放射学会(RSNA)
规模
2.6万+ 图像

肺炎病灶检测框、定位任务

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肺CT

LUNA16

肺结节分析
机构
LIDC/IDRI 联盟
规模
888 例 CT

肺结节检测、候选筛查、分割

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肺CT

LIDC-IDRI

肺部影像数据库
机构
美国国家癌症研究所(NCI)
规模
1018 例 · 4位专家标注

肺结节检测、分割、放射组学

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CT

DeepLesion

全身CT病灶标注
机构
美国国立卫生研究院(NIH)
规模
3.2万 病灶 · 1万+ 患者

通用病灶检测、多病种联合建模

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脑MRI(多序列)

BraTS

脑肿瘤分割挑战
机构
宾夕法尼亚大学 / MICCAI
规模
多模态 MRI · 逐年更新

胶质瘤分割、生存预测、不确定性估计

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MRI / PET

ADNI

阿尔茨海默病神经影像
机构
多中心研究联盟
规模
多中心纵向队列

阿尔茨海默病进展预测、生物标志物研究

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脑MRI

OASIS

开放脑影像系列
机构
华盛顿大学
规模
多版本 · 千级样本

神经退行疾病分割、脑龄预测

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MRI / 基因 / 临床

UK Biobank

英国生物银行
机构
英国生物银行
规模
50万+ 参与者

大规模影像-基因组-表型关联研究

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胸部CT

COVID-CT / STOIC

新冠胸部CT
机构
多机构联合
规模
数千例 CT

COVID-19 肺炎检测、预后分型

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病理图像(全切片 WSI)

以全切片数字病理为核心的公开数据集,常与基因组、临床随访配对,支撑肿瘤检测、分级与预后预测等计算病理学任务。

病理 WSI

TCGA

癌症基因组图谱
机构
NCI / NHGRI
规模
33 癌种 · 1.1万+ 患者

肿瘤分类、预后预测、影像-基因组整合

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病理 WSI

CAMELYON16 / 17

乳腺癌淋巴结转移检测
机构
拉德堡德大学医学中心
规模
约 1400 张 WSI

淋巴结微转移检测、WSI分类

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病理 WSI

PANDA

前列腺癌Gleason分级
机构
拉德堡德 / 卡罗林斯卡学院
规模
1万+ 张 WSI

前列腺癌 Gleason 分级、预后评估

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病理 patch

PatchCamelyon

淋巴结切片小图分类
机构
拉德堡德大学医学中心
规模
32.7万 张 patch

病理patch二分类、计算病理入门基准

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组织转录组

GTEx

基因型-组织表达
机构
美国国立卫生研究院(NIH)
规模
约 1000 捐献者 · 54 组织

基因表达调控、跨组织转录组分析

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专科影像(眼底 / 皮肤)

聚焦眼科与皮肤科的专科影像数据集,是AI辅助筛查落地最成熟的两个方向,标注规范、竞赛众多。

眼底彩照

EyePACS

糖尿病视网膜病变分级
机构
EyePACS
规模
8.8万 张眼底图

糖尿病视网膜病变(DR)分级

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眼底彩照

APTOS 2019

失明风险检测
机构
Aravind 眼科医院
规模
约 5600 张

DR 严重程度分级、失明风险预警

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眼底彩照

IDRiD

印度糖尿病视网膜病变
机构
印度多中心
规模
516 张 · 病灶级标注

DR分级、微动脉瘤/渗出等病灶分割

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双眼眼底彩照

ODIR-5K

眼科多病种识别
机构
北京大学 / 上工医信
规模
5000 患者 · 8 病种

多病种眼科筛查、左右眼联合诊断

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皮肤镜

ISIC Archive

皮肤镜影像档案
机构
国际皮肤影像协作组
规模
10万+ 张皮损图

皮肤病变分类、黑色素瘤筛查

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皮肤镜

HAM10000

人类皮肤病变一万例
机构
维也纳医科大学等
规模
10015 张 · 7 类

皮肤病变7分类、不平衡学习

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电子病历与临床文本

去标识化的真实电子病历与临床文本,支撑临床自然语言处理、疾病预测与医疗信息抽取任务。多数需完成受保护数据使用培训后获取。

电子病历

MIMIC-III

重症监护电子病历
机构
MIT / 贝斯以色列女执事医疗中心
规模
4万+ 住院记录

ICU预后预测、临床NLP、时间序列建模

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电子病历

MIMIC-IV

重症监护电子病历(新版)
机构
MIT / 贝斯以色列女执事医疗中心
规模
30万+ 住院记录

大规模临床预测、多模态时序分析

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电子病历

eICU Collaborative

多中心重症监护数据库
机构
飞利浦 / MIT
规模
20万+ 住院 · 208 家医院

跨中心泛化、ICU 结局预测

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临床文本

n2c2 (i2b2)

临床自然语言处理挑战
机构
哈佛医学院
规模
多任务 · 去标识病历

命名实体识别、关系抽取、去标识化

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文献文本

PMC Open Access

开放获取生物医学文献
机构
美国国家医学图书馆
规模
数百万篇全文

医学知识抽取、问答、预训练语料

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多模态(影像-报告 / 图文)

将医学影像与文本报告、问答配对的多模态数据集,是当前医学多模态大模型与视觉问答研究的关键资源。

X光 + 报告 + EHR

MIMIC-CXR + MIMIC-IV

影像-报告-临床对齐
机构
MIT / 贝斯以色列女执事医疗中心
规模
跨模态对齐

多模态预训练、报告生成、图文对齐

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影像 + 标题

ROCO

放射图像标题数据集
机构
开放医学图像收集
规模
8.1万 张图像

图像-文本对齐、医学视觉语言预训练

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影像 + 标题

MedICaT

医学图像标题与子图
机构
艾伦人工智能研究所
规模
21.7万 张图像

医学图文理解、子图关联、标题生成

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影像 + 问答

VQA-RAD

放射视觉问答
机构
罗切斯特理工大学等
规模
300+ 图 · 3500+ 问答对

医学视觉问答(VQA)、多模态推理

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影像 + 问答

SLAKE

医学视觉问答(含中文)
机构
多机构联合
规模
642 图 · 1.4万 问答对

跨语言医学VQA、视觉语言评测

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医学大模型评测基准

用于系统评估医学大语言模型与多模态模型知识水平、临床推理能力的标准化题库与基准。

文本问答

MedQA (USMLE)

美国执业医师考试题库
机构
多机构收集
规模
1.2万+ 题(USMLE)

医学知识问答、LLM临床知识评测

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文本问答

MedMCQA

印度医学多选问答
机构
多机构收集
规模
19.4万 题

大规模医学多选题评测

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文本问答

PubMedQA

生物医学问答
机构
宾夕法尼亚大学等
规模
21万+ 实例

生物医学问答、文献推理

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文本问答

CMB

中文医学基准
机构
北京协和医院等
规模
26万+ 题

中文医学知识评测、临床应用评估

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说明:以上为思陌智能科研服务整理的公开医疗数据集索引,数据版权与使用条款归各原始发布机构所有,获取与使用请遵守对应平台的授权协议。清单将随科研进展持续更新。